小船於註冊後，遇有小船執照破損或所報事項變更時，小船所有人應自發覺或事實發生之日起三個月內，向航政機關申請換發執照。

小船註冊後，因故申請換發執照時，應將舊照繳銷。

小船所有人未依前項規定繳銷執照，經航政機關命其於一個月內辦理，屆期仍不辦理，而無正當理由者，得由航政機關逕行註銷執照，並於航政機關公告處所及網站公告之。

小船遇有下列情形之一時，小船所有人應向航政機關申請註銷註冊（申請書如附件三），其小船執照除已遺失者外，並應繳銷：

前項第一款至第五款應自事實發生之日起四個月內為之。

小船所有人未依前項規定辦理註銷及繳銷手續，經航政機關命其於一個月內辦理，屆期仍不辦理，而無正當理由者，得由航政機關逕行註銷註冊及註銷執照，並於航政機關公告處所及網站公告之。

申請註冊給照、補發或換發小船執照者，應繳納規費新臺幣五百元。

公務船申請註冊給照、換發或補發執照，免繳費。