中央管理機關應於每年三月前確實辦理海堤安全年度總檢查。其檢查項目如下：
一、海岸地形變化及浪潮衝擊情形。
二、海堤堤身效能狀況與水閘門之開閉、效能靈活程度及各該管單位人員連繫協調情形。
三、海堤損害後修復情形。
四、防汛搶險之各種器材、物料儲備情形。
五、海堤之使用行為。
前項第二款海堤堤身或水閘門有損壞或故障時，應即通知河川分署修繕；第四款防汛搶險之各種器材、物料儲備不足時，應即通知當地直轄市或縣（市）政府補齊。
第一項第五款之使用行為，致妨礙海堤安全或防護功能者，應依本法第九十一條之二規定廢止許可。