園區事業於辦妥設立登記，並經海關核准公告監管後，始得由國外進口保稅貨品。

園區事業進口保稅貨品應依海關相關規定，設立保稅帳冊，並指派專職人員辦理保稅業務。

園區事業尚未辦妥設立登記而需自國外進口保稅貨品者，得檢具土地或廠房租賃契約等文件，向管理局申請專案進口保稅貨品。

前項專案申請應先向海關繳納進口稅款保證金，始得辦理通關手續，並於辦妥設立登記，且經海關公告監管後，再向海關申請退還進口稅款保證金。

園區事業於辦妥設立登記，並經海關核准公告監管後，得檢具有關文件向管理局申請辦理保稅貨品自行點驗進出區及按月彙報業務。

依法令規定合併或分割後存續或新設之園區事業，得申請承受合併消滅或分割前已取得之自行點驗進出區及按月彙報資格。

已具備自行點驗進出區及按月彙報資格之園區事業，位於不同園區之分廠，得向分廠所在地之管理局申請辦理自行點驗進出區及按月彙報之業務。

園區事業於區外之總公司或分公司已具備自行點驗進出區及按月彙報資格者，得向管理局申請辦理自行點驗進出區及按月彙報之業務。

園區事業經核准辦理自行點驗進出區及按月彙報業務者，應聘任二名以上之保稅業務人員（其中一名應為保稅業務主管級人員）辦理保稅業務，並報請海關核准後副知管理局。

園區事業保稅業務人員應具國內、外高中或高職以上學校畢業（含同等學歷資格）或普通考試（含丙等特考）以上考試及格，並應符合下列資格之一：

園區事業經核准自行點驗進出區及按月彙報業務者，其視同進出口案件、委外加工案件、受託加工案件、借料及價值未逾海關核定免繳保證金限額之保稅貨品，運往區外展示、修理、檢驗、組裝測試之案件，得自行點驗進出區。

前項屬視同進出口案件者，得先憑交易憑證文件登帳，於次月十五日前繕具報單，檢附報關必備文件，向海關辦理按月彙報，並應於出區前取得輸出入規定文件。

按月彙報案件，其最後一批貨品進出區日期視同進、出口日期。

園區事業應於製造新產品之翌日起一個月內，產品未出區前，造具各種產品單位用料清表，送海關備查。未送海關備查，而產品已先行出區者，不予除帳。

前項期限，因產品特性或實務作業特殊需求，得經海關專案核准延長之。

第一項產品單位用料清表有申報不實之虞者，海關得予以查核並要求提出製造程序說明書及其他有利查核之相關文件。

園區事業應備置保稅貨品帳冊，報請海關驗印，驗印後依海關規定詳細記錄進、出倉數量、倉庫結存數量及動態紀錄等，供管理局及海關隨時查核之用。

園區事業進口之非保稅原料、物料，可與其他保稅原料、物料相互替代使用者，應一併登列於原料、物料帳管理，並於年度結算時分項列明，合併計算。

園區事業有關保稅之帳冊及編製之表報，應於年度盤存結束後，保存五年；其有關之憑證應保存三年。

前項資料，園區事業得於盤存結案後報經海關核准，以微縮影片、磁帶、磁碟片、光碟片或其他電子媒體等按序攝錄後，依規定年限保存，其原始單證得予銷毀。海關依法進行查案時，如須複印相關資料，園區事業應負責提供。

園區事業應依本條例第二十六條第一項規定備置帳冊，供管理局及海關查核。

園區事業應每年盤存一次，每二年會同會計師盤存一次。但經海關認證為安全認證優質企業或保稅帳冊製作完善，保稅貨品管理健全之園區事業，得於會同會計師盤存之年度盤存日或盤存期限屆滿日一個月前，向海關申請免會同會計師盤存。

盤存日期距上年度盤存日期最短不得少於十個月，最長不得超過十四個月；有特殊情形、事先報經海關核准者，得酌予提前或延長之；海關及管理局認有必要時，得隨時予以盤存。

前項盤存，其未經抽查之項目事後發現錯誤或漏列，且未移往課稅區前，機器設備應於盤存後一個月內向海關申請複查；其餘貨品應於盤存後二週內向海關申請複查，屆期不予受理。

園區事業應於盤存後三個月內根據盤存清冊編製保稅貨品盤存統計表及結算報告表，連同在製品、半製品、成品盤存數折合原料分析表及內外銷成品折合原料分析表，送請海關審核。但有特殊原因，經申請海關核准者，得延長一個月，並以一次為限。

園區事業以研究發展為主要業務且保稅貨品僅有機器、設備者，免會同會計師盤存。

依第一項會同盤存之會計師，以依會計師代理所得稅事務辦法規定核准登記為稅務代理人有案之會計師為限。

具自行點驗進出區及按月彙報資格之園區事業，於年度盤存，其由會計師辦理及簽證者，得免會同海關辦理。由會計師簽證之年度結算報告表，海關得免審核。

園區事業得於盤存日一個月前向海關申請辦理假日盤存。園區事業管理制度健全，保稅貨品控管良好，於盤存當日作業前即能編妥盤存清冊，且符合下列條件之一者，得於盤存日一個月前，向海關申請辦理生產線不停工盤存：

經海關核准辦理不停工盤存之園區事業，應提供有關生產線上保稅貨品相關表報，供稽核關員即時查核，其生產線上之保稅貨品得免編製貨品盤存卡。

海關派員會同盤存時，發現以不停工方式無法查核或有重大弊端時，得令其停工接受盤存或另訂日期停工重盤。

園區事業依前條規定辦理盤存之保稅貨品與當年度帳面結存數量不符時，依下列規定辦理：

園區事業之同一種類或可相互替代使用之原料或物料，其部分為保稅，部分為非保稅，於年度結算時應一併列入盤存。

園區事業之原料盤差容許率依照海關管理保稅工廠分業分類原料盤差容許率表辦理之。

園區事業於撤銷或廢止投資核准、解散或遷出區外前，應依下列規定辦理結束盤存：

園區事業宣告破產者，保稅貨品應依破產法及其相關規定辦理，其因生產或外銷之需要者，得由園區事業提供相當之保證金，經海關核准後提領使用，並應於提領之翌日起一年內檢附出口證明文件向海關辦理銷案，屆期未銷案者，由海關就保證金抵繳應納稅捐。

經撤銷或廢止投資核准、解散、遷出區外或營運不善破產而清算之園區事業，因故無法辦理結束盤存時，海關得逕依帳面結存數課徵應補稅捐。