歸屬於非本會所屬執行單位之研發成果，執行單位應負管理及運用之責；國有研發成果，由本會或所屬機關負管理及運用之責。

前項研發成果管理及運用之範圍，包括申請及確保國內外權利、移轉、授權、讓與、收益、委任、委託、信託、訴訟、衍生新創事業、於我國管轄區域外實施或其他一切與管理或運用研發成果有關之行為。但以讓與、信託、訴訟、交互授權、無償授權、衍生新創事業或於我國管轄區域外實施等方式，應經本會同意後，始得為之。

執行單位依本辦法規定運用研發成果前，應依公開程序將研發成果公告。但依契約約定、經本會同意或法令另有規定者，不在此限。

執行單位辦理研發成果之公告，應以刊登網際網路、全國性報紙、函告業界相關公會或辦理研發成果說明會等方式為之。

執行單位對於研發成果之運用，應符合下列各款之規定：

研發成果之運用，經本會同意以公益目的，或其他更能符合科學技術基本法之宗旨或目的之方式為之者，得不受前項規定之限制。

執行單位運用研發成果時，得參考下列相關因素計價：

研發成果之授權對象為農民團體、個別農民或參與執行該科技計畫業者，研發成果之計價得酌予優惠。

執行單位辦理研發成果授權實施，以非專屬授權方式為之。但產學合作計畫業者出資達計畫總經費百分之三十以上者，得依契約約定獲得專屬授權協商權利。

有下列情形之一者，執行單位得經本會同意後以專屬授權方式為之：

研發成果之授權實施地域、時間、內容、方式，執行單位於必要時得加以限制。

產學合作計畫之每一項計畫參與業者，以一家為限。

前項業者於執行單位辦理研發成果授權實施時，得不經審查取得非專屬授權。

依前條第一項規定取得專屬授權協商權利之業者，於計畫結束後一年內，未與本會或執行單位完成授權契約訂定者，本會或執行單位得逕行授權其他廠商。但有正當理由者，得於期限屆滿前申請展延，展延期限為六個月，並以一次為限。

執行單位基於公益之目的，且經本會同意後，得將研發成果無償授權實施。

前項無償授權期間不得逾五年，被授權人不得再授權；期限屆滿，仍有無償授權之必要者，得再依前項規定辦理。

執行單位基於下列原則，得經本會同意後，將研發成果與其他國家或地區之人民、企業、機關（構），進行國際交互授權：

執行單位依前項國際交互授權所取得之標的，其運用及收入應依本辦法相關規定辦理。

執行單位將研發成果於我國管轄區域外進行運用，應符合下列要件：

執行單位將研發成果於我國管轄區域外進行運用前，應檢具下列相關資料，報請本會同意：

執行單位為促進整體產業發展，經本會同意後，得將研發成果無償讓與具有較佳運用能力之學術或研究機構。

執行單位應與無償讓與之受讓人約定，受讓人應依本辦法規定運用研發成果，並將運用所獲得之總收入依第二十二條規定繳交之。

執行單位不得自行將研發成果製成商品銷售。但有下列情形之一，且經本會同意者，不在此限：

執行單位之研發成果製成商品銷售，應自行評估研發成果價值，並納入成本估算。

前項研發成果收入應依第二十二條規定繳交予本會或所屬機關，或依第二十四條規定分配。

非本會或所屬機關之執行單位，其研發成果收入除本辦法另有規定者外，應依下列方式繳交本會或所屬機關循預算程序撥入國家科學技術發展基金：

本會或所屬機關補助或委託金額未達該科技計畫總經費百分之五十者，執行單位繳交研發成果收入之比率，由雙方約定之。

本會基於整體產業發展得專案同意執行單位繳交研發成果收入之比率，不受第一項規定之限制。

執行單位運用產學合作計畫研發成果之收入，應依前條規定繳交。

本會或所屬行政機關補助或委託金額未達該產學合作計畫總經費百分之五十者，執行單位繳交研發成果收入之比率，由雙方約定之。

本會或所屬機關運用國有研發成果所獲得之收入，應將收入百分之六十循預算程序撥入國家科學技術發展基金，百分之四十分配予創作人及其他有關人員。

接受其他政府機關資助所產生國有研發成果之收入，應依資助機關之規定比率上繳資助機關後，百分之四十分配予創作人及其他有關人員後，餘額部分循預算程序撥入國家科學技術發展基金。

非本會所屬執行單位運用國有研發成果所獲得之收入，應將收入百分之六十循預算程序撥入國家科學技術發展基金，百分之四十分配予創作人或執行單位。

執行單位應就下列事項建立研發成果利益衝突迴避、資訊揭露管理機制：

有關利益迴避、資訊揭露之管理，於行政程序法、或其他法令另有規定者，應依其規定辦理。

創作人應依執行單位規定，主動揭露與擬授權或讓與研發成果之營利事業間，有無下列利益關係；約定於兼職或技術作價投資後取得者，亦同：

簽辦、審議或核決研發成果管理或運用案件之人員，與被授權或讓與研發成果之營利事業間，有前項各款利益關係之一者，應自行迴避。

執行單位知悉創作人或簽辦、審議或核決研發成果管理或運用案件之人員有前二條應自行迴避而未迴避情事者，應命其迴避。

有應自行迴避之情事而不迴避者，利害關係人得向執行單位申請其迴避。

對於是否揭露或迴避有爭議或疑義時，執行單位應召開會議審議，並應提供當事人陳述意見之機會。

因故意或重大過失未依本辦法規定揭露資訊或迴避者，本會或所屬機關應於一定期間內不予全部或一部獎補助。

依公職人員財產申報法第二條第一項所定應申報財產之人員，應遵守公職人員利益衝突迴避法之規定。

本會為加強研發成果之運用，應對非本會或所屬機關之執行單位進行第二十八條研發成果管理制度之評鑑；執行單位未通過評鑑前，其研發成果應歸屬國家所有，並由本會或所屬機關管理。

執行單位通過行政院其他部會辦理之相關評鑑，並於一年內向本會提出證明者，本會得於該執行單位提出證明時起，免除前項評鑑。

本會每三年對通過前二項評鑑之執行單位進行追蹤考評。執行單位未通過追蹤考評者，自本會書面通知後之翌年一月一日起，其研發成果應歸屬國家所有，並由本會或所屬機關管理。

通過評鑑之執行單位應定期以書面向本會報告研發成果管理及運用之情形，並提供相關資料；必要時，本會得要求其說明。

為監督研發成果管理及運用，本會或所屬機關得實地查訪執行單位之研發成果運用情形、紀錄、收支報表或帳簿等相關文件，執行單位應予配合。

非本會所屬執行單位經查核有未依規定切實辦理者，除已依通知期限改善外，必要時，本會或所屬機關得於一定期間內不予全部或一部獎補助。

研發成果歸屬非本會或所屬機關之執行單位，如有下列情形之一者，本會或所屬機關得自行或依申請要求執行單位將研發成果授權第三人實施，或將研發成果收歸國有：

本會或所屬機關依前項規定辦理前，應將通知書或申請書送達研發成果之權利所有權人、受讓人或專屬被授權人，限期三個月內說明；屆期未說明或無正當理由者，本會或所屬機關得逕行處理。

依第一項規定將研發成果授權第三人實施時，被授權人應支付合理對價予權利所有權人、受讓人或專屬被授權人；研發成果之權利所有權人、受讓人或專屬被授權人仍得實施該研發成果。

依第一項規定將研發成果授權第三人實施或收歸國有者，其行使之要件及程序，應以書面契約約定之。