本辦法依科學工業園區設置管理條例 (以下簡稱本條例) 第十九條第二項
規定訂定之。

本辦法規定事項，由科學工業園區 (以下簡稱園區) 管理局或分局 (以下
簡稱管理局或分局) 及依本條例第八條第一項第一款與第二款規定設立之
分支單位執行之。

園區事業於辦妥公司設立登記，並經海關核准公告監管後，始可由國外進
口保稅貨品。
園區事業進口保稅貨品應依海關相關規定，設立保稅帳冊，並指派專職人
員辦理保稅業務。
園區事業尚未辦妥公司設立登記而需自國外進口保稅貨品者，得檢具管理
局或分局同意廠房租賃文件，向管理局或分局申請專案進口保稅貨品。但
需向海關繳納進口稅款保證金，始可辦理通關手續，並於辦妥公司登記後
，再向海關申請退還進口稅款保證金。

園區事業已辦妥營利事業登記並開始營業達三個月以上者，得檢具有關文
件向管理局或分局申請辦理保稅貨品自行點驗進出區及按月彙報業務。
依公司法規定合併或分割後存續或新設之園區事業，得申請承受合併消滅
或分割前已取得之自行點驗進出區及按月彙報資格。
已具備自行點驗進出區及按月彙報資格之園區事業，位於不同園區之分廠
，得準用第一項規定，向分廠所在地之管理局或分局申請辦理自行點驗進
出區及按月彙報之業務。

園區事業經核准辦理自行點驗進出區及按月彙報業務者，應聘任二名以上
之保稅業務人員 (其中一名應為保稅業務主管級人員) 辦理保稅業務。
園區事業保稅業務人員應具國內、外高中或高職以上學校畢業 (含同等學
歷資格) 或普通考試 (含丙等特考) 以上考試及格，並須符合下列條件之
一：
一、經辦保稅業務達二年以上。
二、曾參加關稅主管機關所舉辦保稅業務人員講習並獲得結業證書。
三、曾於海關委託辦理保稅專業訓練之機構接受講習並取得證明。

園區事業經核准自行點驗進出區及按月彙報業務者，其視同進出口案件、
委外加工案件、受託加工案件、借料及價值未逾海關核定免繳保證金限額
之保稅貨品，運往區外展示、修理、檢驗、組裝測試之案件，得自行點驗
進出區。但視同進出口案件，除於出區前應取得輸出入規定文件外，得先
憑交易憑證及裝箱單等文件登帳，於次月十五日前繕具報單檢附單證，向
海關辦理按月彙報。
按月彙報案件，其最後一批貨品進出區日期視同進、出口日期。

園區事業應於製造新產品之翌日起一個月內，產品未出區前，造具各種「
產品單位用料清表」並檢附製造程序說明書，送海關備查。未送海關備查
而產品已先行出區者，不予除帳。
前項「產品單位用料清表」有申報不實之虞者，海關得予以查核。

園區事業應備置保稅貨品帳冊，報請海關驗印，驗印後依海關規定詳細記
錄進、出倉數量、倉庫結存數量及動態紀錄等，供管理局或分局及海關隨
時查核之用。
園區事業進口之非保稅原料、物料，可與其他保稅原料、物料相互替代使
用者，應一併登列於原料、物料帳管理，並於年度結算時分項列明，合併
計算。
園區事業有關保稅之帳冊及編製之表報，應於年度盤存結束後，保存五年
﹔其有關之憑證應保存三年。
前項有關之憑證，園區事業得於盤存結案後報經海關核准，以微縮影片、
磁帶、磁碟片、光碟片或其他電子媒體等按序攝錄後，依規定年限保存，
其原始單證得予銷毀。但海關依法進行查案時，如須複印單證及有關文件
，園區事業應負責提供。
園區事業應依本條例第二十四條第一項規定備置帳冊，供管理局或分局及
海關查核。

本辦法所定之帳冊、表報、放行單證等文件，依海關規定格式印製使用，
園區事業因業務需要必須自行設計格式或更改海關規定格式者，應事先報
請海關核可。

園區事業應每年盤存一次，每二年會同會計師盤存一次。但保稅帳冊製作
完善，保稅貨品管理健全之園區事業，得於會同會計師盤存之年度盤存日
或盤存期限屆滿日一個月前，向海關申請免會同會計師盤存。
盤存日期距上年度盤存日期最短不得少於十個月，最長不得超過十四個月
；如有特殊情形、事先報經海關核准者，得酌予提前或延長之；海關及管
理局或分局認有必要時，得隨時予以盤存。
前項盤存，其未經抽查之項目事後發現錯誤時，應於盤存後二週內，在該
項貨品未動用前，向海關申請複查，逾期不予受理。
園區事業應於盤存後三個月內根據盤存清冊編製盤存統計表、保稅原料結
算報告表，連同在製品、半製品、成品盤存數折合原料分析表及內外銷成
品折合原料分析表，送請海關審核。
園區事業以研究發展為主要業務且保稅貨品僅有機器、設備者，免會同會
計師盤存。
依第一項會同盤存之會計師，以依「會計師代理所得稅事務辦法」規定核
准登記為稅務代理人有案之會計師為限。
具自行點驗進出區及按月彙報資格之廠商，於年度盤存，其由會計師辦理
及簽證者，得免會同海關辦理。由會計師簽證之年度結算報告表，海關得
免審核。

園區事業得於盤存日一個月前向海關申請辦理假日盤存。
園區事業管理制度健全，保稅貨品控管良好，於盤存當日作業前即能編妥
盤存清冊，且符合下列條件之一者，得於盤存日一個月前，向海關申請辦
理生產線不停工盤存：
一、以研究發展為主要業務者。
二、保稅貨品僅有機器、設備者。
三、不停工盤存時能由電腦即時提供生產線上保稅貨品之統計表報者。
經海關核准辦理不停工盤存之園區事業，其生產線上之保稅貨品得免編製
貨品盤存卡。但應提供有關生產線上保稅貨品相關表報，供稽核關員即時
查核。
海關派員會同盤存時，發現以不停工方式無法查核或有重大弊端時，得令
其停工接受盤存或另訂日期停工重盤。

園區事業依前條規定辦理盤存之保稅貨品及機器、設備與當年度帳面結存
數量不符時，依下列規定辦理﹕
一、實際盤存數量少於帳面結存數量，如未逾盤差容許率者，准免補繳稅
捐，逾盤差容許率者，應於接獲海關核發之補稅通知後十日內繕具報
單補繳進口稅捐、貨物稅及營業稅。
二、實際盤存數量多於帳面結存數量者，除應將超過部分之差額併入結存
數外，並應說明理由，如係產品用料量偏高，應修訂產品單位用料清
表，供次年度結算時使用。
園區事業之同一種類或可相互替代使用之原料，如部分為保稅，部分為非
保稅，於年度結算時應一併列入盤存。
園區事業原料盤差容許率依照海關管理保稅工廠分業分類原料盤差容許率
表辦理之。

園區事業於撤銷或廢止投資核准、解散或遷出區外前，應依下列規定辦理
結束盤存：
一、園區事業應向管理局或分局、海關及稅捐機關洽訂或由海關逕予訂定
盤存日期，並得會同管理局或分局辦理盤存。
二、海關及管理局或分局應視實際情形將保稅貨品封存於該園區事業內，
或管理局或分局指定之地點。
三、盤存之保稅貨品，應由園區事業繕具報單補繳稅捐。其盤存數少於帳
面結存數者，應依前條第一項第一款規定辦理補稅。
四、園區事業所有保稅貨品，非經補稅不得輸往課稅區，但因園區事業宣
告破產者，應依破產法及其相關規定辦理，如因生產或外銷之需要，
得由園區事業提供相當之保證金，經海關核准後提領使用，並應於提
領之翌日起一年內檢附出口證明文件向海關辦理銷案，逾期未銷案者
，由海關就保證金抵繳應納稅捐。
經撤銷或廢止投資核准、解散、遷出區外或營運不善破產而清算之園區事
業，如因故無法辦理結束盤存時，海關得逕依帳面結存數課徵應補稅捐。

園區事業之保稅機器、設備進口屆滿五年後，由園區事業自行除帳，屆時
得免列帳監管。但屬戰略性高科技貨品仍應依相關規定辦理。

在園區通關之園區事業進出口保稅貨品應進儲園區海關監管聯鎖倉庫或貨
櫃集中查驗區辦理查驗。但有下列各款情事之一者，得經海關核准在指定
地點查驗︰
一、體積過巨、數量龐大、在倉庫起卸不便者。
二、危險及易腐貨品進儲倉庫有礙安全者。
三、精密器材在倉庫查驗易於毀損變質者。
四、數量未逾十件，每件毛重未逾二十公斤之零星貨品。
五、進儲於園區內保稅倉庫或物流中心者。
六、其他特殊情形經海關專案核准者。

園區事業不得將非屬保稅貨品列為保稅貨品報運進口，如有誤列，應於放
行後三十日內向海關申請補繳稅捐。

園區事業之貨品出入倉 (廠) ，應於二日內登帳，但自國外進口保稅貨品
，應於海關驗放後七日內登帳。

園區事業進口貨品因退貨、調換或其他原因得申請復運出口。
前項復運出口應繕具報單，依一般貨品輸出規定向海關辦理通關手續。

課稅區廠商售予園區事業自用之機器、設備、原料、物料及半製品，依本
條例第二十三條規定視同外銷，買賣雙方應聯名繕具報單，檢附發票及裝
箱單等，向海關辦理通關手續，經海關放行後，核發視同出口報單副本交
賣方廠商憑以辦理沖退及減免稅捐。

保稅工廠、保稅倉庫、加工出口區區內事業、物流中心或農業科技園區之
園區事業以保稅貨品售予園區事業自用者，視同出口及進口，買賣雙方應
聯名繕具報單，檢附發票、裝箱單及其他有關文件向海關辦理通關手續。
園區事業以保稅貨品售予保稅工廠、農業科技園區之園區事業或加工出口
區區內事業，或進儲保稅倉庫、物流中心者，視同出口及進口，買賣雙方
應聯名繕具報單，檢附發票、裝箱單及其他有關文件，向海關辦理通關手
續。
自由港區事業貨物售予園區事業或園區事業保稅貨品售予自由港區事業，
依自由貿易港區貨物通關管理辦法相關規定辦理。

視同外銷貨品發生退貨情事時，應於進廠後三個月內由買賣雙方聯名填具
退貨申請書，並繕具報單，向海關辦理通關手續；原已核發視同出口證明
文件者，應收回註銷。已辦理沖退或減免稅捐者，應繳回已沖退稅款並通
知所屬稅捐稽徵機關，始可退貨出區。
進廠三個月後發生之前項退貨案件，應按一般進口程式辦理通關手續，並
依法課稅。
前條視同出口及進口貨品發生退貨情事時應由買賣雙方聯名繕具退貨申請
書，並繕具報單向海關辦理通關手續。

園區事業以成品出口，應繕具報單依一般貨品出口之規定向海關辦理通關
手續。
前項在園區通關之出口貨品，應由海關在指定倉庫或地點查驗，經放行後
監視裝入保稅卡車或貨櫃加封交運，並簽發出口貨載運單、貨櫃 (物) 運
送單或貨櫃清單，隨貨封送出口地海關，經出口地海關核明後，以出口貨
載運單或出口貨櫃清單第二聯送回海關銷案。
園區事業進、出口貨品得選擇在進、出口地海關依通關之作業規定辦理通
關手續。

園區事業以成品售予稅捐記帳之外銷加工廠再加工外銷者，買賣雙方應聯
名繕具報單檢附發票、裝箱單及其他有關文件，向海關辦理通關手續。
前項外銷加工廠之稅捐記帳，應依外銷品沖退原料稅捐辦法之規定辦理，
並以海關簽放報單日期為視同出口及進口之日期。

前條之買賣發生退貨時，應依下列規定辦理﹕
一、由買賣雙方聯名繕具退貨申請書及報單，檢附發票、裝箱單及原報單
影本註明「ｘｘ報單退貨」字樣，於出區後三個月內向海關辦理通關
手續。原出售之園區事業已領有視同出口證明者，海關應通知稅捐稽
徵機關。
二、海關辦理前款手續後，核發退稅用報單副本供原購買廠商辦理沖稅。

園區事業以保稅貨品售予同區內園區事業，買賣雙方應聯名繕具報單連同
裝箱單及其他有關文件，於交易後次月十五日前，向海關辦理通關手續，
並得採按月彙報方式辦理。

園區事業以保稅貨品售予其他園區之園區事業，買賣雙方應聯名繕具報單
並檢附裝箱單及其他有關文件，向賣方海關辦理通關手續。具自行點驗進
出區及按月彙報資格之園區事業，得於交易後次月十五日前，向海關辦理
按月彙報。
園區事業以非交易行為方式，將保稅貨品交付同園區或其他園區之園區事
業者，視同出口及進口，應繕具報單並檢附裝箱單及其他相關文件，向海
關辦理通關手續。
園區事業以非交易行為方式，將保稅貨品交付其設於其他園區之分廠者，
依前項規定辦理；具自行點驗進出區及按月彙報資格之園區事業，其機器
、設備移轉案件，可免進倉查驗，由保稅業務人員自行點驗進出廠並依規
定辦理按月彙報。

園區事業以其產品作為樣品或贈品，售予或贈送國內外廠商及參觀之客戶
，其非屬貿易主管機關公告限制輸出入貨品項目且價值未逾美金二萬元者
，依下列規定辦理：
一、售予或贈與課稅區廠商者，應繕具報單，向海關辦理通關手續。
二、寄送國外廠商者，應繕具報單依產品外銷程式，向海關辦理通關手續
。
三、交與到廠參觀之國外客戶、由廠方人員或快遞業者攜帶出口、民間團
體出國餽贈外賓之禮品者，應填具「園區事業保稅貨品攜帶出口申請
書」，由海關或具有按月彙報資格園區事業保稅業務人員核明加封交
國外客戶、廠方人員、快遞業者或民間團體具領出區，於出區後二十
日內憑出口地海關出口證明銷案。但由園區事業保稅業務人員核放之
「園區事業保稅貨品攜帶出口申請書」案件應於出區後三日內，向海
關備案。
四、政府機關派員出國、或接待來訪外賓向園區事業購買禮品贈送外國人
士者，應憑院屬一級機關證明及收據銷案。
前項第三款、第四款貨品未能銷案，亦未運回廠內者，應於銷案期限屆滿
後十日內，繕具報單按出廠型態補稅。
園區事業以其原料、零組件、儀器設備交與到廠之國外客戶、廠方人員或
快遞業者出口至國外測試、維修，非屬貿易主管機關公告限制輸出入貨品
項目，且價值未逾美金二萬元者，準用第一項第三款規定辦理。
第一項及前項之限額得由管理局或分局會同海關依實際狀況彈性調整。

園區事業輸出國外或由國外輸入之貨品，如以空運或郵寄數量在十件以下
，每件毛重未逾二十公斤，其輸入時，得填具「園區事業空運或郵寄少量
原料包裝加封交運進廠申請書」，向海關申請核准，交由該園區事業所派
人員攜運進廠；輸出時，得交郵寄出或比照輸入程序辦理。但在運送中遺
失者，應由園區事業補繳稅捐。

由課稅區輸入園區保稅範圍之貨品，其不申請減免或退稅者，得免辦手續
入區。但園區事業購進機器，日後有退回、掉換或運返課稅區者，於運返
課稅區時，由該園區事業填具「科學工業園區生產性貨品出區放行單」出
區。

園區事業之成品由其他廠商或貿易商報運出口者，應依第二十二條規定辦
理，其出口報單於出口後交由園區事業除帳，出口廠商不得申請退稅。

內銷課稅區之保稅貨品，應繕具報單，報經海關補徵進口稅捐後，始准放
行出區，但屬貿易主管機關公告限制輸出入貨品項目者，須經管理局或分
局核准。屬售予課稅區廠商再加工外銷者，應另行報明並加附一份退稅用
報單副本由海關驗證後逕送退稅單位，供加工外銷出口後辦理退稅。
前項內銷課稅區之貨品，發現損壞或規格、品質與原訂合約不符，須由園
區廠商賠償或調換者，該項賠償或調換之出區貨品，免繳關稅，但以在原
貨品放行後一個月內提出申請，並檢附有關證件，經海關查明屬實者為限
。如機器、設備內銷課稅區後，運回園區修理、裝配者，應依關稅法相關
規定辦理。
內銷課稅區之產品依下列方式之一課徵關稅﹕
一、國內有產製者，按出廠時形態完稅價格減除百分之三十後之餘額課徵
進口關稅。
二、其產品為保稅範圍外尚未能產製者，依所使用原料或零件課徵進口關
稅。

前條內銷課稅區之貨品，得依第五條、第六條及下列規定辦理自行點驗進
出區及按月彙報業務﹕
一、產品內銷補稅案件若以課稅區廠商為納稅義務人，並由園區事業提供
相當金額之擔保，保證繳納課稅區廠商應繳納之相當稅費者，得由園
區事業與課稅區廠商聯名繕具報單，向海關申請按月彙報。
二、設置按月彙報內銷登記簿，於出廠前按出廠批數逐批登記內銷日期、
品名、規格、數量、價格及預估稅額後，於保證金數額內准由園區事
業先行提貨出廠。
三、園區事業應於次月十五日以前，將上月內銷貨品彙總繕具報單辦理補
稅。

園區事業在生產過程中所產生之副產品、廢品、下腳等，均應按類別、性
質依序儲存於倉庫或經管理局或分局及海關認可之地點，屬半製品之廢品
，並應分別列明以備查核。
前項所稱廢品，指園區事業所有不堪使用之機器、設備、零組件或材料，
其本身事業不能利用者；或未經製造過程，仍屬資產之一部分者﹔或其產
品及設備因災害受損，本身事業不能利用，仍屬資產之一部分者。
第一項所稱下腳，指園區事業在其製造過程中，所殘餘之渣滓、廢料，且
該事業不能利用者﹔或非經產製過程所積存之渣滓、廢料、包裝從物，且
不屬於資產之一部分者。

前條副產品、廢品、下腳等，應依下列規定處理﹕
一、有利用價值部分﹕園區事業應於事前向管理局或分局申請專案核准；
由管理局派員或委託專業機構會同海關、稅捐稽徵機關現場監毀。其
屬貿易主管機關公告限制輸出入貨品項目者，園區事業應另向管理局
或分局申請許可證，經海關依關稅法有關規定核定完稅價格計徵稅捐
後，由園區事業補稅提領出區；園區事業亦得經管理局或分局核准，
以預估每年處理監毀數量，依其剩餘價值事先補稅。園區事業於海關
及管理局或分局監毀後，得在預先補稅額度內准予提領出區。
二、無利用價值部分﹕由管理局派員或委託專業機構會同海關監毀。
前項廢品、下腳等，其未在產品單位用料清表用料量中另列有損耗率或未
經核准者，得核實沖銷保稅原料帳。
經核准處理之廢品、下腳等，園區事業應依據廢棄物清理法之規定處理。
第一項保稅貨品報廢業務，得以電子作業方式辦理。

園區事業存倉過程中之保稅貨品遭受失竊而致短少，經向警察機關報案取
得證明文件並報請海關查明屬實者，應自失竊之翌日起三個月內補稅除帳
；如有特殊情形，報經海關核准者，得申請提供保證金暫免補稅，但最長
不得超過六個月。期滿後仍未找回者，由海關逕以保證金抵繳稅款結案，
找回之部分海關應將保證金退還。

園區事業間借入、借出及歸還原料、物料、燃料、半製品、成品，應由雙
方聯名填具「園區事業借入 (出) 原料、物料、燃料、半製品、成品申請
書」，向海關申報辦理驗放及進 (出) 廠手續，並由各該園區事業點收或
歸還銷案後登入帳冊。
前項案件得依第五條、第六條規定，辦理自行點驗進 (出) 廠，並於進 (
出) 廠五日內檢送「園區事業借入 (出) 原料、物料、燃料、半製品、成
品申請書」向海關報備。
前二項由園區事業借出之原料、物料、燃料、半製品或成品，應自借出之
日起三個月內歸還，逾期不還或未向海關銷案者，應即依第二十五條規定
補辦通關及轉帳手續，其情節重大者，並得停止受理雙方園區事業借出入
案件之申請半年。

園區事業之原料或半製品運往園區外加工所委託加工之廠商，以從事科學
技術研究發展之研究機構或已辦妥工廠登記之工廠為限。
委託加工應檢附合約書或經委、受託加工雙方簽署之訂單、加工廠商之公
司與工廠登記證明文件，向管理局或分局申請核准；委託加工案件之申請
，得以電子文件方式辦理之。
前項委託加工案件，加工廠商所添加之原料不得申請退稅，但加工廠商為
科學工業園區園區事業、加工出口區區內事業、農業科技園區之園區事業
或保稅工廠者，得申請除帳。
園區事業以自己名義由加工廠商或設立於其他關區之分廠處直接出口加工
品者，應檢具出口地海關核發之報單副本向海關銷案。

園區事業自備之保稅模具得經管理局或分局核准後運出區外，供委託加工
之加工廠或跨關區另設之分廠使用；其申請方式及期限依前條委託加工之
規定辦理之。

區外廠商以其原料或半製品委託園區事業加工，園區事業應檢附委託加工
合約書或訂單，委託加工廠商之營利事業證明文件，向管理局或分局申請
核准。
園區事業受託加工，須添加保稅原料者，於加工品出區時，應繕具報單，
向海關辦理通關手續。

園區事業之保稅貨品運往區外委託代為修理、檢驗或組裝測試者，應填具
「科學工業園區保稅貨品運出區修理、檢驗或組裝測試申請書」報請海關
審核並繳納稅款保證金後放行出區。
前項運往區外之保稅貨品屬戰略性高科技貨品及價值逾海關核定限額之機
器、設備者，應經管理局或分局核准後向海關申請出區。前項及本項作業
，得以電子傳輸方式處理。
第一項保稅貨品，如價值未逾海關核定限額者，得免繳保證金，逕憑「生
產性貨品出區放行單」申請出區，並得依第五條、第六條規定，辦理自行
點驗進、出區。

前條保稅貨品修理、檢驗或組裝測試後，應於出區後三個月內運回，運回
區內時應填具「園區事業出區保稅貨品運回進廠申請書」，向海關辦理銷
案及退還保證金手續。未依限運回者，應於期滿後十日繕具報單補稅。
前項出區之保稅貨品，其情形特殊不能於期限運回者，應檢具區外受理廠
商或他關區分廠書面資料，於期限前提出申請，經海關查明屬實後，始准
展延，但機器、設備應經管理局或分局同意，且合計期限不得超過六個月
。

園區事業產品出區展示，應填具「園區事業產品出區展示申請書」報請海
關審核並繳納稅款保證金後放行出區。出區展示產品運回時，應填具「園
區事業出區展示產品運回進廠申請書」向海關辦理銷案手續。
前項產品價值未逾海關核定限額者得免繳保證金逕憑「生產性貨品出區放
行單」向海關申請出區手續，並得依本辦法第五條、第六條規定，自行點
驗進、出區。
產品出區展示時間不得超過二個月，情形特殊者，得於期限屆滿前申請展
期，但合計期限不得超過三個月，期滿即應運回，未依期限運回者，應於
期滿後十日繕具報單補稅。

本辦法自發布日施行。