食品及食品添加物查驗登記等相關審查費、證書費收費標準如下：
一、錠狀膠囊狀食品之查驗登記，每件新臺幣四千元。
二、食品添加物之查驗登記，每件新臺幣六千元。
三、低酸性罐頭食品之查驗登記，每件新臺幣六千元。
四、特殊營養食品之查驗登記，分別如下：
（一）嬰兒與較大嬰兒配方食品：每件新臺幣三千元。
（二）特定疾病配方食品：每件新臺幣六萬元，其行審查會議程序者，每件加收新臺幣十四萬元。
五、基因改造食品原料之查驗登記，每件新臺幣二十五萬元。
六、食品添加物、低酸性罐頭食品、錠狀膠囊狀食品及特殊營養食品之許可證件（許可文件）展延、變更、遺失補發、移轉、污損換發，每件新臺幣四千元。
七、基因改造食品原料之許可證變更登記、展延者，每件新臺幣六千元。
八、基因改造食品原料之許可證遺失補發、污損換發、移轉者，每件新臺幣八千元。
九、食品及食品添加物查驗登記核發、換發、補發之許可證，每件新臺幣一千五百元。
十、食品、食品添加物之自由銷售證明、檢驗報告、衛生證明書申請案之書面審查，每件新臺幣二千元。
十一、食品、食品添加物之衛生證明、檢驗報告英文證明申請案之實地查核或抽驗，每件新臺幣四千三百元。（本款費用未包含實驗室之檢驗費用）
十二、食品、食品添加物之自由銷售證明、檢驗報告、衛生證明書，正本每件新臺幣一千元，副本每份新臺幣一百元。