本基金之收支、保管及運用，應設運動發展基金管理會（以下簡稱管理會），置委員十九人至二十一人，其中一人為召集人，由本部部長兼任，一人為副召集人，由本部體育署署長兼任；其餘委員應由本部遴聘（派）相關機關（構）與團體代表、金融、主計、經濟、法律與體育專家學者、運動產業及運動選手代表兼任；任期二年，期滿得續聘（派）兼之。但代表機關（構）或團體出任者，應隨其本職進退。

管理會委員任一性別委員不得少於委員總數三分之一。

管理會委員出缺時，得補行遴聘；其聘期至原聘任委員任期屆滿之日止。

管理會每四個月開會一次，必要時得召開臨時會議，均由召集人召集之；召集人未克出席時，由副召集人代理之；召集人、副召集人均未克出席時，由召集人指定委員一人代理。

前項會議，得邀請有關機關（構）或團體派員列席。

第一項會議之紀錄，應由主管機關依政府資訊公開法規定於機關網站對外公開。

本辦法自中華民國九十九年一月一日施行。

本辦法中華民國一百零二年一月二十三日修正發布條文，自一百零二年一月一日施行；一百零三年一月二日及一百零九年十二月二十三日修正發布條文，自發布日施行。